bio
oric y ars
La secuencia Ori C presente en el DNA
bacteriano determina el punto en donde
dará comienzo la duplicación. Esta secuencia
tiene un tamaño de 245 pb y posee
palíndromos de la secuencia GATC que se
encuentran metilados. Dentro de ella se
localizan los sitios R y una región rica en A-T
conocida como DUE (elemento de
desenrollamiento del DNA). En eucariotas se
postula que existen múltiples secuencias de
inicio a lo largo del cromosoma, siendo ARS
la mejor conocida.
DNaA
Los sitios R de Ori C son reconocidos por las
proteínas DNaA, cuya unión incrementa la
tensión y favorece la desnaturalización de la
secuencia DUE, dando lugar a la apertura de
la horquilla de duplicación. Las proteínas
DnaA son separadas de la cadena gracias a
la escisión de ATP inducido por la proteína
Hda.
PUCS
RPA
PUCS
(proteínas de unión al DNA de cadena
sencilla; SSB) aparecen y se unen a las
cadenas separadas para evitar que estas
vuelvan a unirse
Helicasa DNaB
mcm
La DNA helicasa (DNaB)
se monta en cada extremo de la burbuja de
duplicación y comienza a desenrollar las
cadenas mediante la ruptura de los puentes
de H (mediante el gasto de ATP).
topoisomerasa II (DNA
girasa)
se encarga de liberar la tensión por
superenrollamiento para que la helicasa
pueda seguir separando las cadenas.
Para
disminuir esta tensión, las topoisomerasas
clase I cortan solo una cadena y vuelven a
sellarla, mientras que las topoisomerasas
clase II cortan ambas cadenas
ciprofloxacino
un antibiótico que
pertenece a la familia de las quinolonas,
cuya función es inhibir la actividad de la
topisomerasa II bacteriana para así evitar la
síntesis de DNA.
primasa (DNaG)
pol a
coloca segmentos de RNA
(primers o cebadores) de 10 a 60
nucleótidos en cada una de ellas.
primosoma
pol a, DNaB y DNaG
DNA pol III
incapaz de leer la cadena
que se dirige de 5´a 3´, por lo que requiere
formar un asa en sentido 3´a 5´ para poder
copiarla
RNasa H
retira los primers de RNA
DNA pol l
sustituye los espacios donde estaba el primer por segmentos de dna
al serexonucleasa 5 a e tambien puede eliminar primer
Eucariotas
DNA pol epsidon
sintetisa cadena lider
DNA pol δ delta
sintetiza cadena rezagada
sustituye primers con dna
DNA ligasa
cataliza la
formación de enlaces fosfodiéster mediante
el uso de NADH (procariotas) o ATP
(eucariotas)
Aciclovir
consiste en una guanina unida
a un anillo incompleto de ribosa al que no se
le pueden agregar nuevos nucleótidos
Cuando la DNA Pol del virus une el aciclovir
en lugar de guanina a la cadena, la
duplicación del DNA viral termina de forma
prematura.
RNA mensajero (mRNA).
Al ser una copia de un gen, posee la información
necesaria para producir una proteína
RNA ribosomal (rRNA)
Los distintos subtipos de RNAr se unen para dar
lugar al ribosoma, este es una ribozima capaz de leer al mRNA para sintetizar
una proteína.
RNA de transferencia (tRNA
Transporta los diferentes aminoácidos hacia el
ribosoma durante la síntesis proteica.
RNA micro (miRNA).
Regula la expresión del mRNA, favorece su degradación
al hibridarse con él cuando ya no es necesario.
RNA pequeño nuclear (snRNA)
Al asociarse a proteínas forman los snRNP
(snurps); sus diversos subtipos se unen para formar al spliceosoma, la
ribozima encargada de realizar el corte y empalme del mRNA.
RNA pequeño nucleolar (snoRNA).
Coordinan la edición del RNAr y del
RNAt.
Las subunidades que forman a la RNA pol poseen diferentes funciones:
β. Lleva a cabo la síntesis de RNA (actividad polimerasa).
σ. Reconoce al promotor para dar inicio a la transcripción.
ρ. Participa en la finalización de la transcripción.
RNA pol
lee la cadena en sentido 3´a 5´ y sintetiza la copia de RNA en
dirección 5´a 3´
no requiere primers ni actividad correctora de pruebas
Cadena Molde
cadena del DNA copiada por la RNA pol es la que se encuentra en dirección 3
´a 5´ y se denomina cadena molde.
promotores bacteriano
Caja de Pribnow (TATAAT). Ubicada 10 pares de bases antes del sitio de
inicio de la transcripción (a -10).
TTGACA. Localizada a 35 pb antes del sitio de inicio de la transcripción (-35).
Elemento corriente arriba (UP). Presente a 40 a 60 pb antes del sitio de inicio
de la transcripción (entre -40 y -60), es rico en AT.
Una vez que la subunidad σ se une al promotor, permite la unión de la RNA
polimerasa para formar
complejo de carga cerrado
cuando el RNA alcanza una longitud de 10 pb, la
subunidad sigma se separa del complejo y es reemplazada por la
proteína NusA
La unión de NusA da comienzo a la elongación de la cadena de RNA
Terminación dependiente de ρ.
La subunidad ρ (rho) reconoce a la secuencia rut rica en CA al final del gen.
A continuación, rho activa su función helicasa y avanza en sentido 5´a 3´ en
dirección a la RNA Pol, al alcanzarla, la polimerasa se disocia del DNA.
Terminación independiente de ρ.
Hacia el final del DNA que se transcribe se encuentra una secuencia rica en
GC (que disminuye la velocidad de síntesis de la RNA pol) y una secuencia
poli A, la cual es copiada por la RNA pol para formar un segmento poli U en el
RNA. La presencia de este segmento en el RNA provoca la formación de una
horquilla que impide que la transcripción continúe, separando a la RNA pol del
DNA y de NusA.
eucariotas existen 3 RNA pol distintas:
RNA pol I. Lleva a cabo la síntesis del preRNA 45s que forma a los RNAr 18S,
28S y 5.8S, estos constituyen el ribosoma eucariota.
RNA pol II. Transcribe al RNAm, miRNA y al snRNA que forma a U1, U2, U4,
U5.
RNA pol III. Forma los precursores del RNAt, a los snoRNA (RNA pequeño
nucleolar), al RNAr 5S (que se une a los otros rRNA para formar al
ribosoma), y al snRNA que da lugar a U6 (que al asociarse a los otros U
crean al spliceosoma).
actinomicina D
antibiótico capaz de inhibir la transcripción,
interacciona con las GC localizadas en el DNA para provocar su distorsión.
rifampicina
inhibidor de la subunidad beta de la RNA pol bacteriana y
se usa en el tratamiento de la tuberculosis
amanitina
toxina producida por hongos del género Amanita y es
capaz de bloquear a la RNA pol II de los eucariotas. Su ingestión es peligrosa, ya
que conduce a falla hepática y renal.
eucarotas promotores
Oa Caja TATA (caja Hogness) o dispersos (se distribuyen de manera aleatoria)
como las islas CpG. Otros ejemplos de promotores son las secuencias BRE,
DPE y MTE.
potenciadores (enhancers)
son secuencias localizadas a miles de pares de bases del promotor y que
favorecen la transcripción al unirse a proteínas transactivadoras.
TFIIA y B.
refueran
zan interaccion entre TBP y TATA
TFIIF
permite la adición de la RNA pol.
TFII H
Helicasa. Desenrolla al ADN para abrir la horquilla de transcripción y dar
lugar al complejo de iniciación abierto. También permite el avance de la RNA
pol.
Cinasa. Se encarga de fosforilar el segmento carboxilo terminal de la RNA
pol (CTD) que permite la activación de la enzima.
Para terminar el proceso dectranscricion, la RNA pol debe
desfosforilarse
En los eucariotas el mRNA debe madurar mediante la realización de 3
modificaciones
Introducción del casquete 5´
Formación de la cola poli A.
Splicing (corte y empalme). Eliminación de intrones y unión de exones.