molecolare
La riparazione per escissione di nucleotidi (NER) ripara quali tipi di lesioni al DNA?
Lesioni ingombranti che distorcono l'elica del DNA
Qual è la principale differenza tra trasposoni a DNA e retrotrasposoni riguardo al loro meccanismo di movimento?
I trasposoni a DNA si muovono con un meccanismo di 'taglia e incolla', mentre i retrotrasposoni si muovono tramite un intermedio di RNA che viene retrotrascritto a DNA e poi integrato.
Spiega due differenze principali nell'organizzazione cellulare tra procarioti ed eucarioti.
I procarioti non hanno scomparti interni con membrana (il DNA è nel nucleoide), mentre gli eucarioti hanno cromosomi nel nucleo e organuli distinti (mitocondri, cloroplasti, RE, Golgi) con funzioni specifiche.
Cosa garantisce l'elevata processività della DNA polimerasi replicativa?
La 'pinza scorrevole'
Il dogma centrale della biologia molecolare spiega come dal DNA si forma la ____________ che definisce la sequenza della proteina.
RNA
Quali sono i quattro istoni fondamentali del core nucleosomico negli eucarioti?
H2A, H2B, H3 e H4
Descrivi brevemente il meccanismo di ricongiungimento delle estremità non omologo (NHEJ) per riparare le rotture a doppio filamento.
Le estremità rotte vengono complesse da proteine come Ku, che le proteggono e le tengono unite. DNA-PKcs fosforila altre proteine, e la DNA Ligasi IV le sigilla, spesso con perdita di alcune basi.
La ploidia si riferisce a:
Il numero di copie di un genoma in un organismo
Qual è il livello di organizzazione conformazionale di una proteina che descrive le regioni locali di strutture regolari ripetute (ad esempio alfa-elica o beta-foglietto)?
Secondario
Spiega la differenza chiave nella struttura dello zucchero tra DNA e RNA.
Il DNA contiene 2’-deossi-D-ribosio (manca un atomo di ossigeno al C2'), mentre l'RNA contiene D-ribosio (ha un atomo di ossigeno aggiuntivo al C2').
Quale enzima è responsabile della sintesi di un primer di RNA per iniziare la replicazione del DNA?
Primasi
Nei procarioti, cosa provoca la proteina RelA in risposta a una carenza di aminoacidi?
Produce (p)ppGpp che blocca le GTPasi e la traduzione
Descrivi il meccanismo di terminazione rho-indipendente nei procarioti.
La terminazione rho-indipendente è determinata da una sequenza di DNA palindromica che, una volta trascritta, forma una forcina nell'RNA. Questa forcina blocca l'RNA polimerasi e il debole appaiamento UA causa il distacco dell'enzima.
Descrivi i legami idrogeno e la loro direzionalità nelle macromolecole.
Il legame idrogeno è un tipo di legame non covalente dovuto a cariche parziali da legami covalenti polari. È direzionale, influenzato dall'angolo dei dipoli, e influenza le strutture delle macromolecole.
Quale macromolecola è composta da monomeri di zuccheri e fornisce energia?
Polisaccaridi
Qual è la funzione principale dei telomeri?
Essere essenziali per la stabilità del cromosoma
Qual è la funzione dei codoni di stop nella traduzione?
Segnalano la terminazione della traduzione.
Descrivi le principali caratteristiche della fase M (mitotica) del ciclo cellulare.
Nella fase M, i cromatidi fratelli si separano, un set completo di cromosomi viene spostato a ogni polo della cellula e la membrana nucleare si rompe, seguita dalla citochinesi che divide la cellula in due figlie.
Quale tecnica è utilizzata per quantificare in modo sensibile, specifico e riproducibile lo stampo presente in una reazione di amplificazione del DNA?
Real time PCR (qPCR)
Cosa si intende per 'editing dell'RNA' e quale tipo di modificazione comporta?
L'editing dell'RNA si riferisce a modifiche post-trascrizionali delle basi dell'RNA, come inserzioni, delezioni o modificazioni di basi (es. deaminazione da adenosina a inosina).
L'acetilazione della lisina negli istoni è associata alla:
Trascrizione attiva
In che modo i fosfolipidi formano la membrana cellulare?
Si dispongono in un doppio strato lipidico con teste idrofiliche a contatto con gli esterni acquosi e code idrofobiche all'interno.
Cos'è il superavvolgimento negativo del DNA e perché è importante?
Il superavvolgimento negativo si verifica quando vengono tolti dei twist alla molecola di DNA, inducendo incroci destrorsi (writhe negativo). Questo favorisce l'apertura della doppia elica, facilitando processi come replicazione e trascrizione.
La maggior parte degli esosi e dei pentosi presenti in natura sono isomeri di tipo:
D
In una SDS-PAGE, perché l'SDS è essenziale per separare le proteine in base alla dimensione?
L'SDS denatura le proteine e conferisce loro una carica negativa uniforme, annullando le cariche intrinseche e permettendo la separazione per dimensione.