Biokemi del 2
Cellmembran
Uppbyggnad
Behöver hjälp över
Vad hjälper till i över
Transport med och mot koncentrationsgradienten
Uppbyggnad - Lipider och proteiner, dubbellager av fosfolipider med en hydrofil och hydrofob sida
Behöver hjälp över - Vattenlösliga ämnen (hindras från att tränga genom lipidskitet), joner (binder till vattenmolekyler och det skulle kräva energi för att förlytta jonen från vattenlösningen till membranet) och stora polära molekyler (ex. glukos)
Vad hjälper till över - transportprotein, exempel kanaler (jonkanaler är proteiner som transporterar laddade ämnen) och pumpar (transporterar ämnen mot deras koncentrationsgradient med hjälp av energi.
Lipider - bildar ett dubbellager
Protein - transporterar ämnen och receptorer för hormoner och signalsubstanser
Speciella egenskaper hos aminosyror:
- Stel struktur på grund av ett sidokedjan är ringsluten med alfta-aminogruppen
- Har inte något kiralt centrum
- Kan bilda disulfidbryggor
- Har ett pKa-värde som ligger nära fysiolgiskt pH
- Har oladdad sidokedja men är polär på grund av en hydroxylgrupp
- Har en positivt laddad sidokedja
- Prolin
- Glycin
- Cystein
- Histidin
- Tyrosin
- Lysin
Proteins struktur
- Primär struktur
- Sekundär struktur
- Tertiär struktur
- Kvartär struktur
- Är grunden till proteinets funktion och struktur, har peptidbindningar (kovalenta bindningar). Är den nivå som bestämmer vad för protein det ska bli
- Den nivån som proteinet får sin stadga och där vecken börjar att formas. Ligger i grund för veckningen hos den tertiära strukturen, alfta-helix och beta-strängar, vätebindninar
- Här bildas proteinet, den veckas klart och får den struktur och funktion som bestämdes i primära strukturen. Vätebindningar, jonbindningar, disulfidbindningar och hydrob interaktion.
- Finns inte i alla proteinprocesser utan finns bara i det proteiner som behövs sättas ihop för att funka, vätebindningar, jonbindningar, disulfidbindningar och hydrob interaktion.
Fosfolipid
Hydroba svansar - hatar vatten
Hydrofilt huvud - älskar vatten
Byggstenar - 2 fettsyror, 1 glycerol och 1 fosfatgrupp
Viktig kompontent i cellmembranetm dubbelskikt, svansar inåt och huvud utåt, fungerar som barriär
Aldoser och Ketoser
Aldoser är när kolhydrater har en aldehydgrupp tillexempel glukos
Ketoser är när kolhydrater har en ketogrupp tillexempel fruktos
Cellulosa, sträkelse och glykogen
Cellulosa -
Förekomst- växters struktuella funktion
Uppbyggda - beta-bindningar och helt ogrenade
Stärkelse -
Förekomst - växternas energilagring
Uppbyggda - alfa - bindningar, är lite grenade
Glykogen -
Förekomst - Djur och människors energilagring
Uppbyggda - Alfta - bindingar, är väldigt grenade.
Zwitterjoner
- Vilka joniseringsbara grupper har en aminosyra
- Vilken nettoladdning vid pH 1, pH 7 och pH 14
- En aminosyra och laddning vid pH 7
- en alfta-aminogruppen och alfta-karboxylsyregruppen
- pH 1 positiv laddning, pH 7 - neutral laddning och pH 14 negativ laddning
-Prolin är oladdad alltså hydrofob vid pH 7
Enzymer
Uppgift - biologisk katalysatorer som påskyndar kemiska reaktioner i levande organismer utan att själv förbrukas
Enzymer har ett aktivt säte där substartmolekylerna binds och omvandlas till produkte, binds samman av svaga bindningar/interaktioner, vilket gör dem lätta att bryta igenom.
Exempel på hur enzymer kan hindras utföra sitt arbete
Irreversibel inhibering - inhibitor binder permanent till ett enzym och inaktiverar det fullständigt.
Kompetitiv inhibering - binder till enzymets aktiva säta och konkurrerar därmed med substratet, liknar suvstratet, om substrat tillsätts i överskött konkurreras inhibitorn ut
Nonkompetitiv inhibering - binder till någon annanstans på enzymet än det aktiva sätet, leder till minskad katalytisk förmåga för enzymet, kan inte konkurreras ut av ett överskott av substratet
Triacylglycerol, fosfolipider och glykolipider
Triacylglycerol -
Uppbyggnad - Sestrar bildade av glycerol och 3 fettsyror, en glycerolmolekyl är förestrad med tre fettsyror genom esterbindningar, fettsyrorna kan va av olika sorter
Vart - Lagras i fettceller
Fosfolipider -
Struktur - Två fettsyror
Vart - Bygger upp biologiska membran
Glykolipider
Struktur - Har en kolhydratdel, innehåller stringosin istället för glycerol
Vart - Utsidan av cellmembran, framför allt i nervvävnad
Aktiv och passiv transport
Passiv transport - Kräver ingen energi, ämnen transporteras med sin elektrokemiska gradient
- Enkel diffusion: hydrofoba fettlösliga ämnen kan tränga sig genom membranet elektrokemiska gradient, exempel syrgas och koldioxid
- Underlättad diffusion: Hydrofila ämnen får hjälp genom membranet av proteiner som binder dom specifikt, exempel glukos
Aktiv transport - Kräver transportproteiner och energi, transport sker mot sin elektrokemiska gradient
- Exempel Na+/K+ pumpen
Glukos och fruktos
Glukos - Aldohexos (sex kolatomer och en aldehydgrupp), öppen kolkedja har glukos en karbonylgrupp på kolatom nr 1, cyklisk form bildar glukos en pyranosring
Fruktos - Ketohexos (sex kolatomer och ketogrupp), öppen kedjeform har karbonylgrupp på kolatom nr 2, cyklisk form bildar fruktos en furanosring
Bindning av glykosidbindningar
- Bildas när det anomera kolet i en monosackarid reagerar med en hydroxylgrupp (-OH) i en annan molekyl, vilket kan vara en annan monosackarid, alkohol, amin eller fosfatgrupp
- Exempel sukros (består av glukos och fruktos)