Uppsättning av funktionella grupper som är essentiella för grunden till en viss typ av LM.
Via naturen
Endogena ligander: E.g. lead förening såsom adrenalin liknar Isoprenalin (B-adrenoceptor agonist) i kemisk struktur, bara att adrenalin är aktiv på både a- och b-drenerga receptroer.
Via litteratur: Känt LM ---> vidareutvecklar för ex. göra LM med högre efficacy eller affinitet.
Screening: High throuhgput screening (HTS); testar tusentals kemiska substanser samtidigt med samma ligand med mikrotitplattor och en höghastighetsrobot.
Datorbaserad LM design: 3D-modellering av e.g. enzym där man sen kan designa ligander och se om de passar i det aktiva centrumet.