Molecular
Qué es la transcripción
Transferencia de información genética de DNA a RNA, es decir, de cadena doble a sencilla
Qué es la unidad de transcripción
Es un fragmento de DNA que va a producir una molécula de RNA de cadena sencilla (puede involucrar uno o varios genes)
¿Dónde se encuentra la unidad de transcripción y que lo compone?
Se encuentra entre el promotor y la región de terminación
Promotor----DNA-----Terminador
Una unidad de transcripción es
Región reguladora (rio arriba= -) Región estructural (rio abajo=+)
A que se refiere con rio arriba y rio abajo
Río arriba se refiere a que va encontra corriente es decir que va en dirección 5´, por lo que esta es negativa - (es la región reguladora) y río abajo se refiere a que es hacia 3´ por ello es en sentido de la corriente, por lo que es + (es la región estructural)
Qué es el transcrito primario?
Es el producto inmediato de la transferencia de información de DNA, es decir, los subtipos que se generan de RNA
En procariotes , qué enzima se encarga de iniciar la transcripción
RNA pol, es regulada por factores de transcripción y proteínas asociadas a la transcripción
En bacterias, es fundamental Factor sigma
En eucariotas, es fundamental factores y proteínas de iniciación
RNA informacional
mRNA sirve para decódificar cadenas de péptidos
RNA funcional/estrucural
Nunca son códificantes de proteínas su acción es a nivel del RNA pude tener varias funciones
Cuales tipos de RNA son fundamentales para todos los organismos
tRNA, mRNA rRNA
Tipos de procesamiento de RNA en eucariotes: snRNA, scRNA
snRNA: Se encarga del procesamiento del transcrito primario
scRNA: Trafico citoplasmatico, basicamente se encarga de que las proteínas lleguen a su destino
Regulación y estabilidad de mRNA
microRNA: Se encarga de estabilizar y proteger el RNA mensajero postraaduccional
ribo switch: Modula la expresión y represión de genes
neRNA: regulación postraduccional
Transcripción en procariotes
Donde se recluta el factor sigma y por qué ahí?
Se recluta río arriba, en las regiones -10 y -35 debido a que son sitios ricos en Adeninas y Timinas
Transcipción procariotes
recordar que el factor sigma recluta la RNA pol.
¿Cuáles son las subunidades de RNA Pol y cual es su función?
Holoenzima activa: forma reclutada de las subunidades alfa (a), beta (b), b´, omega (w) y sigma (s)
a: Ensambla el dominio cooh y NH3 Terminal
b: Sitio catalítico
b´: Unión al DNA
s: Permite reclutar RNA pol y iniciar la transcripción
w: Protege la subunidad b
Transcipción procariotes
Elementoss del núcleo enzimatico del factor sigma?
2 subunidades alfa, una b y b´. Este núcleo puede catalizar la polimerización pero NO iniciar la transcripción sin sigma
La RNA pol tiene actividad editora y correctora al igual que la DNA pol?
FALSO, ninguna RNA tiene estas acciones
La cadena no templada (Crick o +), la cadena templado (Whatson o -). Como identificas la cadena templada
Se compara la cadena de RNA naciente con las cadenas de DNA y según sea su concordancia con alguna de las cadenas, esta cadena será la códificante. Recordar que el transcrito primario o cadena de RNA recien sintetizada tiene U en lugar de T
Alargsamiento de transcripto primario en procariote
La RNA pol cataliza la sintesis de enlaces fosfodiester mediante la energia de ruptura de NTP
Terminación- Transcipción procariotes
La terminación puede ser de dos formas: Dependiente de Rho y independiente de Rho
Dependiente de Rho: Hay receptores tipo Rho que unen al hexamero de proteína Rho que desestabiliza la cadena de RNA pol o DNA ocasionando su liberación
Independiente de Rho: Secuencias en forma de asas, liberan la cadena
Región promotora
Secuencias reconocidas por factores transcripcionales, INR (inicio de transcripción en eucariotes) + caja TATA =Promotor basal o mínimo
Secuencias reconocidas por promotores río arriba
Caja TATA, caja GC: Aumentan la eficiencia del evento de iniciación
Enharcer (potenciadores) regulan la función del mismo, reconocen factores río arriba, pueden o no formar parte del promotor, pueden estar a más de 1000 pb del promotor
Qué es un factor de transcripción
Códifican a mRNA y permite la diferenciación celular
Factores generales: Requeridos al inicio de la sintesis de RNA EN TODOS LOS EUCARIOTES
Factores 5´
Son especificos para los promotores y activadore, escencialmente permiten que los promotores funcionen a un nivel adecuado y este puede ser compartido para la expresión completa de un gen
Factores inductibles
Son reguladores
Se unen a elementos de respuesta, que controlan la transcriçion en tiempo y forma
¿Cuál de los factores permiten expresar un gen?
Factores generales y 5´ río arriba, expresan constitutivamente un gen
Factores de elongación
Permite separa entre el DNA y histonas así la RNA puede interacturar directamente con el DNA, basicamente son eficientadores
Factores de transcripción
Unen al promotor y ayudan a iniciar la transcripción.
Estabilizan el DNA y permiten eficientar la transcripción
Terminación en EUCARIOTES
1- RNA pol II continua transcribiendose aun despues de terminar el gen.
2- RNA Pol II reconoce regiones rica en Adeninas y Timinas, los cuales, se encuentran despues de 3´ de la región códificante
3- El premRNA es reconocido por una endonucleasa especifica y corta hacia 3´ terminal
4-Se adiciona una cola polia A
Modelo de torpedo
RNAasa degradan RNA hasta que se encuentran con la RNA pol II provocando una desestabilización y paro de sintesis
¿Cómo se madura el pre-mRNA?
A traves de un proccesamiento alternativo (splicing). Se suprimen los intrones y se reclutan los exones para madurar el pre-mRNA. Un snRNA se une y corta los extremos de los intrones liberando los exones que posteriormente se van a terminar de unir por una ligasa formando asi un mRNA maduro
¿Por qué es importante el splicing alternativo?
Da variabilidad de mRNA que codificaran a distinatas proteínas, esto se debe a factores proteícos y RNA no códificante
Cómo se regula la transcripción en eucariotes?
Hay dos mecanismo de regulación
Regulación expresión genética/Variación del número de enzimas
Metabolica (producto final)